SARS-CoV-2-Queries

virusProteinsAll.rq

Code examples: curl

SPARQL

SELECT ?virus ?virusLabel ?protein ?proteinLabel ?refseq ?uniprot WHERE {
  VALUES ?virus {
    wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
    wd:Q16983360 # HKU1
    wd:Q16991954 # OC43
    wd:Q8351095  # NL63 
    wd:Q16983356 # 229E
    wd:Q4902157  # MERS-CoV
    wd:Q278567   # SARS-CoV
  }
  ?protein wdt:P703 ?virus ; wdt:P31 wd:Q8054 .
  OPTIONAL { ?protein wdt:P637 ?refseq }
  OPTIONAL { ?protein wdt:P352 ?uniprot }
  SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "pt,en". }
} ORDER BY ?virus

run or edit

Output

virus protein refseq uniprot
Coronavírus humano 229E (edit) Non-structural protein 4a (edit) NP_073552.1 P19739
Coronavírus humano 229E (edit) Non-structural protein 4b (edit) NP_073553.1 P19740
Coronavírus humano 229E (edit) Spike glycoprotein (edit) NP_073551.1 P15423
Coronavírus humano 229E (edit) Membrane protein (edit) NP_073555.1 P15422
Coronavírus humano 229E (edit) Nucleoprotein (edit) NP_073556.1 P15130
Coronavírus humano 229E (edit) Envelope small membrane protein (edit) NP_073554.1 P19741
Coronavírus humano 229E (edit) Replicase polyprotein 1a (edit) NP_073550.1 P0C6U2
Coronavírus humano 229E (edit) Replicase polyprotein 1ab (edit) NP_073549.1 P0C6X1
Coronavírus humano HKU1 (edit) Hemagglutinin-esterase (edit) YP_173237.1 Q5MQD1
Coronavírus humano HKU1 (edit) Membrane protein (edit) YP_173241.1 Q5MQC7
Coronavírus humano HKU1 (edit) Protein I (edit) YP_173243.1 Q5MQC5
Coronavírus humano HKU1 (edit) Spike glycoprotein (edit) E0YJ44
Coronavírus humano HKU1 (edit) Non-structural protein 4 (edit) YP_173239.1 Q5MQC9
Coronavírus humano HKU1 (edit) Spike glycoprotein (edit) YP_173238.1 Q5MQD0
Coronavírus humano HKU1 (edit) Envelope small membrane protein (edit) YP_173240.1 Q5MQC8
Coronavírus humano HKU1 (edit) Nucleoprotein (edit) YP_173242.1 Q5MQC6
Coronavírus humano HKU1 (edit) Replicase polyprotein 1ab (edit) YP_173236.1 P0C6X2
Coronavírus humano OC43 (edit) envelope protein (edit) YP_009555243.1
Coronavírus humano OC43 (edit) ns2 (edit) YP_009555239.1
Coronavírus humano OC43 (edit) ns12.9 (edit) YP_009555242.1
Coronavírus humano OC43 (edit) nucleocapsid protein (edit) YP_009555245.1
Coronavírus humano OC43 (edit) spike surface glycoprotein (edit) YP_009555241.1
Coronavírus humano OC43 (edit) Orf1ab (edit) YP_009555238.1
Coronavírus humano OC43 (edit) membrane protein (edit) YP_009555244.1
Coronavírus humano OC43 (edit) hemagglutinin-esterase (edit) YP_009555240.1 P30215
SARS-CoV (edit) Protein 3a [SARS-Cov] (edit) NP_828852.2 P59632
SARS-CoV (edit) Replicase polyprotein 1a (edit) P0C6U8
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) spike glycoprotein (edit) YP_009047204.1 K9N5Q8
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) nucleoprotein (edit) YP_009047211.1 K9N4V7
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) NS3 protein (edit) YP_009047205.1 K9N796
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) NS4B protein (edit) YP_009047207.1 K9N643
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) Envelope small membrane protein (edit) K9N5R3
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) Replicase polyprotein 1ab (edit) K9N7C7
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) Non-structural protein ORF5 (edit) K9N7D2
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) Replicase polyprotein 1a (edit) K9N638
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) Membrane protein (edit) K9N7A1
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) nucleocapsid protein (edit) YP_009047211.1
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) spike protein (edit) YP_009047204.1
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 10 [SARS CoV-2] (edit) YP_009725306 P0DTC1-PRO_0000449644
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 10 [SARS CoV-2] (edit) YP_009725306 P0DTD1-PRO_0000449628
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 15 [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725310 P0DTD1-PRO_0000449632
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 16 [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725311 P0DTD1-PRO_0000449633
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Papain-like proteinase [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725299.1 P0DTC1-PRO_0000449637
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Papain-like proteinase [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725299.1 P0DTD1-PRO_0000449621
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 5 [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725301 P0DTC1-PRO_0000449639
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 5 [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725301 P0DTD1-PRO_0000449623
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) nucleocapsid protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724397.2 P0DTC9
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) spike glycoprotein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724390.1 P0DTC2
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) orf1ab polyprotein [SARS-Cov 2] (edit) YP_009724389.1 P0DTD1
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Viroporin 3a [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724391.1 P0DTC3
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) envelope protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724392.1 P0DTC4
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) membrane protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724393.1 P0DTC5
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 6 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449640
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) non-structural protein 6 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449624
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF1a polyprotein (edit) YP_009725295.1 P0DTC1
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Protein 7a [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724395.1 P0DTC7
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Protein non-structural 7b [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725318.1 P0DTD8
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF8 protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724396.1 P0DTC8
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 2 [SARS CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449636
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 2 [SARS CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449620
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF6 protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009724394.1 P0DTC6
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF10 protein [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725255.1 A0A663DJA2
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Protein ORF9b [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD2
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 9 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449643
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 9 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449627
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Host translation inhibitor nsp1 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449635
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Host translation inhibitor nsp1 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449619
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 4 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449638
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 4 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449622
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 7 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449641
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 7 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449625
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) RNA-directed RNA polymerase [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725307 P0DTD1-PRO_0000449629
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 14 [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725309 P0DTD1-PRO_0000449631
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Helicase [SARS-CoV-2] (edit) YP_009725308 P0DTD1-PRO_0000449630
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein nsp8 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTC1-PRO_0000449642
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein nsp8 [SARS-CoV-2] (edit) P0DTD1-PRO_0000449626
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) putative protein ORF3c (edit) P0DTG1
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) Non-structural protein 11 [SARS CoV-2] (edit) YP_009725312 P0DTC1-PRO_0000449645
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF3b protein [SARS-CoV-2] (edit) P0DTF1
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) ORF9c protein [SARS CoV-2] (edit) P0DTD3
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) S1 Subunit of Spike Protein (edit) P0DTC2-PRO_0000449647
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) S2 Subunit of Spike Protein (edit) P0DTC2-PRO_0000449648
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) S2' Subunit of Spike Protein (edit) P0DTC2-PRO_0000449649
Coronavírus humano NL63 (edit) Spike glycoprotein [NL63] (edit) YP_003767.1 Q6Q1S2
Coronavírus humano NL63 (edit) Non-structural protein 3 (edit) YP_003768.1 Q6Q1S1
Coronavírus humano NL63 (edit) Envelope small membrane protein (edit) YP_003769.1 Q6Q1S0
Coronavírus humano NL63 (edit) Nucleoprotein (edit) YP_003771.1 Q6Q1R8
Coronavírus humano NL63 (edit) Membrane protein (edit) YP_003770.1 Q6Q1R9
Coronavírus humano NL63 (edit) Replicase polyprotein 1ab (edit) YP_003766.2 P0C6X5

Code examples

curl

curl -s https://raw.githubusercontent.com/egonw/SARS-CoV-2-Queries/master/sparql/virusProteinsAll.rq | sed 's+<lang/>+pt+' > virusProteinsAll.rq

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