SARS-CoV-2-Queries

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Hacia una solución

Actualmente no existe una solución para el SARS-CoV-2.

Pero hay ideas sobre qué soluciones podrían ser. Una vacuna es una de ellas, pero su desarrollo lleva tiempo [1]. Pero también se habla de anticuerpos y reutilización de drogas. Todo esto es muy exploratorio en este momento. Los ensayos clínicos son importantes (consulte la sección Ensayos clínicos).

Este capítulo muestra una serie de consultas con información en Wikidata sobre clientes potenciales que las personas han propuesto que pueden conducir a una solución.

Anticuerpos

Los anticuerpos están ganando interés. La siguiente consulta enumera artículos sobre los coronavirus humanos y también anotados con el término ‘anticuerpo’:

SPARQL sparql/antibodies.rq (ejecutar, editar)

SELECT ?virus ?virusLabel ?work ?workLabel WITH {
  SELECT ?virus ?work WHERE {
    VALUES ?virus {
      wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
      wd:Q16983360 # HKU1
      wd:Q16991954 # OC43
      wd:Q8351095  # NL63 
      wd:Q16983356 # 229E 
      wd:Q4902157  # MERS-CoV
      wd:Q278567   # SARS-CoV
    }
    ?work wdt:P921 ?virus ;
          wdt:P921 wd:Q79460 .
  }
} AS %ARTICLES WHERE {
  INCLUDE %ARTICLES
  SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "es,en". }
}
ORDER BY ?virusLabel ?virus ?workLabel ?work

La lista se está haciendo larga, así que primero vamos a mostrar la cantidad de artículos sobre anticuerpos para cada virus:

virus count
SARS coronavirus (edit) 48
MERS-CoV (edit) 16
SARS-CoV-2 (edit) 13
Human coronavirus 229E (edit) 2
Human coronavirus OC43 (edit) 1

Se debe enfatizar que los anticuerpos son específicos para cada proteína y cada coronavirus tiene proteínas diferentes, y esta lista es solo para incluir en la literatura relevante para leer, no para sacar conclusiones de:

virus work
Human coronavirus 229E (edit) Antibody to virus components in volunteers experimentally infected with human coronavirus 229E group viruses. (edit)
Human coronavirus 229E (edit) Detection of human coronavirus 229E-specific antibodies using recombinant fusion proteins. (edit)
Human coronavirus OC43 (edit) Development of a recombinant truncated nucleocapsid protein based immunoassay for detection of antibodies against human coronavirus OC43 (edit)
MERS-CoV (edit) A conformation-dependent neutralizing monoclonal antibody specifically targeting receptor-binding domain in Middle East respiratory syndrome coronavirus spike protein. (edit)
MERS-CoV (edit) A humanized neutralizing antibody against MERS-CoV targeting the receptor-binding domain of the spike protein. (edit)
MERS-CoV (edit) A safe and convenient pseudovirus-based inhibition assay to detect neutralizing antibodies and screen for viral entry inhibitors against the novel human coronavirus MERS-CoV (edit)
MERS-CoV (edit) A truncated receptor-binding domain of MERS-CoV spike protein potently inhibits MERS-CoV infection and induces strong neutralizing antibody responses: implication for developing therapeutics and vaccines (edit)
MERS-CoV (edit) Exceptionally potent neutralization of Middle East respiratory syndrome coronavirus by human monoclonal antibodies. (edit)
MERS-CoV (edit) Investigation of anti-middle East respiratory syndrome antibodies in blood donors and slaughterhouse workers in Jeddah and Makkah, Saudi Arabia, fall 2012. (edit)
MERS-CoV (edit) Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) RNA and neutralising antibodies in milk collected according to local customs from dromedary camels, Qatar, April 2014. (edit)
MERS-CoV (edit) Middle East respiratory syndrome coronavirus antibody reactors among camels in Dubai, United Arab Emirates, in 2005. (edit)
MERS-CoV (edit) Middle East respiratory syndrome coronavirus neutralising serum antibodies in dromedary camels: a comparative serological study. (edit)
MERS-CoV (edit) Middle East respiratory syndrome coronavirus spike protein delivered by modified vaccinia virus Ankara efficiently induces virus-neutralizing antibodies. (edit)
This table is truncated. See the full table at sparql/antibodies.rq

Reutilización de drogas

La sección ?? ya incluía una descripción general de los ensayos clínicos. Este da una idea de los síntomas que preocupan a las personas. También proporciona información sobre qué medicamentos se estudian para la reutilización. Algunos de estos han recibido mucha atención, otros menos. Ellos se ven asi:

La siguiente consulta enumera el número de ensayos clínicos por intervención:

SPARQL sparql/clinicalTrialsByIntervention.rq (ejecutar, editar)

SELECT ?intervention ?interventionLabel (COUNT(?trial) AS ?trials) WHERE {
  VALUES ?topic {
    wd:Q84263196 wd:Q82069695
  }
  ?trial wdt:P31 wd:Q30612 ;
         wdt:P921  ?topic ;
         wdt:P4844 ?intervention .
  SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "es,en". }
} GROUP BY ?intervention ?interventionLabel
  ORDER BY DESC(?trials) ASC(?intervention)

Esto da:

intervention trials
hidroxicloroquina (edit) 43
Cloroquina (edit) 15
Lopinavir (edit) 15
Ritonavir (edit) 15
Chloroquine diphosphate bearing dextran nanoparticles augmented drug delivery and overwhelmed drug resistance in Plasmodium falciparum parasites (edit) 12
COVID-19 (edit) 11
tocilizumab (edit) 6
interferón (edit) 4
óxido nítrico (edit) 4
agente antiviral (edit) 4
Losartán (edit) 4
paracetamol (edit) 4
Prednisolona (edit) 3
This table is truncated. See the full table at sparql/clinicalTrialsByIntervention.rq

Es importante destacar que esta lista solo da una idea de qué intervención ha recibido más atención que otras. Y es esencial darse cuenta de que la atención no es una medida de éxito.

Referencias

  1. Lu S, Lu S. Timely development of vaccines against SARS-CoV-2. Emerging microbes & infections. 2020 Mar 8;9(1):542–4. doi:10.1080/22221751.2020.1737580 (Scholia)