SARS-CoV-2-Queries

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Rumo a uma solução

Atualmente não existe uma solução para o SARS-CoV-2.

Há, contudo, ideias sobre como as soluções poderiam ser. Uma vacina é uma possível solução, mas seu desenvolvimento leva tempo [1]. Também se fala em uso de soros (anticorpos) e reaproveitamento de drogas conhecidas. Tudo isso é muito exploratório nesse momento. Os ensaios clínicos são importantíssimos (consulte a seção Ensaios clínicos).

Este capítulo mostra uma série de buscas de informações no Wikidata sobre agentes relacionados à busca de soluções para a COVID-19.

Anticorpos

A busca por anticorpos eficazes tem ganhado bastante tração. A consulta a seguir enumera artigos sobre os coronavírus humanos também anotados com o termo ‘anticorpo’:

SPARQL sparql/antibodies.rq (run, edit)

SELECT ?virus ?virusLabel ?work ?workLabel WITH {
  SELECT ?virus ?work WHERE {
    VALUES ?virus {
      wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
      wd:Q16983360 # HKU1
      wd:Q16991954 # OC43
      wd:Q8351095  # NL63 
      wd:Q16983356 # 229E 
      wd:Q4902157  # MERS-CoV
      wd:Q278567   # SARS-CoV
    }
    ?work wdt:P921 ?virus ;
          wdt:P921 wd:Q79460 .
  }
} AS %ARTICLES WHERE {
  INCLUDE %ARTICLES
  SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "pt,en". }
}
ORDER BY ?virusLabel ?virus ?workLabel ?work

A lista está crescendo bastante, então vamos mostrar somente a quantidade de artigos sobre anticorpos para cada vírus:

virus count
SARS-CoV (edit) 48
coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (edit) 16
coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (edit) 13
Coronavírus humano 229E (edit) 2
Coronavírus humano OC43 (edit) 1

Deve-se enfatizar que os anticorpos são específicos para cada proteína e cada coronavírus tem proteínas diferentes. Essa lista, então, é apenas um agregados de artigos relevantes, mas não para se tirar conclusões imediatas.

virus work
Coronavírus humano 229E (edit) Antibody to virus components in volunteers experimentally infected with human coronavirus 229E group viruses. (edit)
Coronavírus humano 229E (edit) Detection of human coronavirus 229E-specific antibodies using recombinant fusion proteins. (edit)
Coronavírus humano OC43 (edit) Development of a recombinant truncated nucleocapsid protein based immunoassay for detection of antibodies against human coronavirus OC43 (edit)
SARS-CoV (edit) A SARS DNA vaccine induces neutralizing antibody and cellular immune responses in healthy adults in a Phase I clinical trial. (edit)
SARS-CoV (edit) A double-inactivated whole virus candidate SARS coronavirus vaccine stimulates neutralising and protective antibody responses. (edit)
SARS-CoV (edit) A human SARS-CoV neutralizing antibody against epitope on S2 protein. (edit)
SARS-CoV (edit) A single immunization with a rhabdovirus-based vector expressing severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) S protein results in the production of high levels of SARS-CoV-neutralizing antibodies (edit)
SARS-CoV (edit) Amino acids 15-28 in the ectodomain of SARS coronavirus 3a protein induces neutralizing antibodies. (edit)
SARS-CoV (edit) An efficient method to make human monoclonal antibodies from memory B cells: potent neutralization of SARS coronavirus. (edit)
SARS-CoV (edit) Antibodies against trimeric S glycoprotein protect hamsters against SARS-CoV challenge despite their capacity to mediate FcgammaRII-dependent entry into B cells in vitro. (edit)
SARS-CoV (edit) Antibodies to SARS coronavirus in civets. (edit)
SARS-CoV (edit) Antibody response and viraemia during the course of severe acute respiratory syndrome (SARS)-associated coronavirus infection. (edit)
SARS-CoV (edit) Antibody response of patients with severe acute respiratory syndrome (SARS) targets the viral nucleocapsid. (edit)
null sparql/antibodies.rq

Reuso de medicamentos

A seção 8.3 inclui uma descrição geral dos ensaios clínicos. Esta aqui dá uma ideia dos sintomas que preocupam às pessoas. Também traz informações sobre quais medicamentos se estudam para reuso. Alguns destes tem recebido mais atenção, outros menos.

A busca a seguir conta o número de ensaios clínicos no Wikidata por intervenção de pesquisa:

SPARQL sparql/clinicalTrialsByIntervention.rq (run, edit)

SELECT ?intervention ?interventionLabel (COUNT(?trial) AS ?trials) WHERE {
  VALUES ?topic {
    wd:Q84263196 wd:Q82069695
  }
  ?trial wdt:P31 wd:Q30612 ;
         wdt:P921  ?topic ;
         wdt:P4844 ?intervention .
  SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "pt,en". }
} GROUP BY ?intervention ?interventionLabel
  ORDER BY DESC(?trials) ASC(?intervention)

Isso nos dá:

intervention trials
Hidroxicloroquina (edit) 43
cloroquina (edit) 15
lopinavir (edit) 15
ritonavir (edit) 15
Chloroquine diphosphate bearing dextran nanoparticles augmented drug delivery and overwhelmed drug resistance in Plasmodium falciparum parasites (edit) 12
COVID-19 (edit) 11
tocilizumabe (edit) 6
interferon (edit) 4
óxido nítrico (edit) 4
antiviral agent (edit) 4
losartan (edit) 4
paracetamol (edit) 4
prednisolona (edit) 3
null sparql/clinicalTrialsByIntervention.rq

É importante destacar que essa lista só dá uma ideia de quais intervenções tiveram mais atenção que as outras. É essencial perceber que atenção NÃO é uma medida de sucesso.

Referências

  1. Lu S, Lu S. Timely development of vaccines against SARS-CoV-2. Emerging microbes & infections. 2020 Mar 8;9(1):542–4. doi:10.1080/22221751.2020.1737580 (Scholia)