これらのクエリはいくつかの課題に関する最新10件分の記事を取得します。これは、 Scholia [1]とは異なります。Scholiaは特定の課題について遥かに豊かな文献の概要が得られます。各節ではScholiaへのリンクを含めています。ここでのクエリはとても基本的なもので、「主題」プロパティのみを利用します。
SARS-CoV-2がこのウイルスの名前です。
SPARQL sparql/litSARSCoV2.rq (実行, 編集)
SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE {
?work wdt:P921 wd:Q82069695 .
OPTIONAL { ?work wdt:P577 ?dates . }
OPTIONAL { ?work wdt:P356 ?doi . }
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
} GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date) ?work
結果として10件の論文を得ます。
遺伝子についても文献を検索できます。
SPARQL sparql/litSARSCoV2Genes.rq (実行, 編集)
SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE {
?gene wdt:P703 wd:Q82069695 ; wdt:P31 wd:Q7187 .
?work wdt:P921 ?gene .
OPTIONAL { ?work wdt:P577 ?dates . }
OPTIONAL { ?work wdt:P356 ?doi . }
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
} GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date)
これにより、現在以下の結果を得ます。
そしてウイルスタンパク質について
SPARQL sparql/litSARSCoV2Proteins.rq (実行, 編集)
SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE {
?protein wdt:P703 wd:Q82069695 ; wdt:P31 wd:Q8054 .
?work wdt:P921 ?protein .
OPTIONAL { ?work wdt:P577 ?dates . }
OPTIONAL { ?work wdt:P356 ?doi . }
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
} GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date)
結果は現在、以下の通りです。
2章で概説した通り、SARS-Cov-2はヒトに感染するコロナウイルスの一つです。
SPARQL sparql/litCoronaviruses.rq (実行, 編集)
SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE {
?work wdt:P921 wd:Q57751738 .
OPTIONAL { ?work wdt:P577 ?dates . }
OPTIONAL { ?work wdt:P356 ?doi . }
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
} GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date)
次の10件を取得できます。
Wikidataには、7つのヒトコロナウイルスに関する記事が6千件以上あります。次のクエリは検索速度向上のために少し複雑になっています。また、得られる記事のリストが非常に長く、このページには表示しきれません。結果を見たい場合は、 litHumanCoronaviruses.rqファイルとある部分の下をクリックしてください。
SPARQL sparql/litHumanCoronaviruses.rq (実行, 編集)
SELECT ?date ?work ?workLabel ?virus ?virusLabel ?doi ?pubmed WITH {
SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?doi ?virus WHERE {
VALUES ?virus {
wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
wd:Q16983360 # HKU1
wd:Q16991954 # OC43
wd:Q8351095 # NL63
wd:Q16983356 # 229E
wd:Q4902157 # MERS-CoV
wd:Q278567 # SARS-CoV
}
?work wdt:P577 ?dates ;
wdt:P921 ?virus .
} GROUP BY ?work ?doi ?virus
ORDER BY DESC(?date)
LIMIT 5000
} AS %ARTICLES WHERE {
INCLUDE %ARTICLES
OPTIONAL { ?work wdt:P356 ?doi . }
OPTIONAL { ?work wdt:P698 ?pubmed . }
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
}
ORDER BY DESC(?date) ?doi ?pubmed ?virus
さらに、個々のウイルスに関する記事の数は非常にまちまちであり、このクエリでそれを可視化できます。
SPARQL sparql/litHumanCoronavirusesCounts.rq (実行, 編集)
SELECT ?virus ?virusLabel ?count WITH {
SELECT ?virus (COUNT(DISTINCT ?work) AS ?count) WHERE {
VALUES ?virus {
wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
wd:Q16983360 # HKU1
wd:Q16991954 # OC43
wd:Q8351095 # NL63
wd:Q16983356 # 229E
wd:Q4902157 # MERS-CoV
wd:Q278567 # SARS-CoV
}
?work wdt:P921 ?virus .
} GROUP BY ?virus
} AS %ARTICLES WHERE {
INCLUDE %ARTICLES
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
}
ORDER BY DESC(?count)
以下の結果が得られます。
| virus | count |
| SARSコロナウイルス2 (edit) | 25971 |
| SARS関連コロナウイルス (edit) | 2492 |
| MERSコロナウイルス (edit) | 1053 |
| ベータコロナウイルス１ (edit) | 116 |
| ヒトコロナウイルス229E (edit) | 110 |
| ヒトコロナウイルスNL63 (edit) | 94 |
| ヒトコロナウイルスHKU1 (edit) | 22 |
SPARQL sparql/litHumanCoronavirusesGeneCounts.rq (実行, 編集)
SELECT ?virus ?virusLabel ?gene ?geneLabel ?count WITH {
SELECT ?virus ?gene (COUNT(DISTINCT ?work) AS ?count) WHERE {
VALUES ?virus {
wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
wd:Q16983360 # HKU1
wd:Q16991954 # OC43
wd:Q8351095 # NL63
wd:Q16983356 # 229E
wd:Q4902157 # MERS-CoV
wd:Q278567 # SARS-CoV
}
?gene wdt:P703 ?virus ; wdt:P31 wd:Q7187 .
?work wdt:P921 ?gene .
} GROUP BY ?virus ?gene
} AS %ARTICLES WHERE {
INCLUDE %ARTICLES
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
}
ORDER BY DESC(?count)
以下の結果が得られます。
SPARQL sparql/litHumanCoronavirusesProteinCounts.rq (実行, 編集)
SELECT ?virus ?virusLabel ?protein ?proteinLabel ?count WITH {
SELECT ?virus ?protein (COUNT(DISTINCT ?work) AS ?count) WHERE {
VALUES ?virus {
wd:Q82069695 # SARS-CoV-2
wd:Q16983360 # HKU1
wd:Q16991954 # OC43
wd:Q8351095 # NL63
wd:Q16983356 # 229E
wd:Q4902157 # MERS-CoV
wd:Q278567 # SARS-CoV
}
?protein wdt:P31 wd:Q8054 .
{ ?protein wdt:P703 ?virus }
UNION
{ ?protein wdt:P702 | ^wdt:P688 ?gene . ?gene wdt:P703 ?virus }
?work wdt:P921 ?protein .
} GROUP BY ?virus ?protein
} AS %ARTICLES WHERE {
INCLUDE %ARTICLES
SERVICE wikibase:label { bd:serviceParam wikibase:language "ja,en". }
}
ORDER BY DESC(?count) ?virus ?protein
そして、以下のクエリでそれらを取得します。